Как вернуть переплату по налогам, если заплатил НДФЛ с продажи квартиры, хотя минимальный срок владения уже прошёл

Раз минимальный срок владения квартирой на момент продажи истёк, налог с продажи в принципе не должен был начисляться, и то, что вы когда-то заплатили по требованию налоговой, не лишает права на возврат - согласие с необоснованным требованием само по себе долга не создаёт, если по существу налога не было.

Начать стоит с проверки: закажите в личном кабинете или в инспекции выписку по единому налоговому счёту (ЕНС) и посмотрите, как выглядит сальдо - положительное сальдо там подтвердит, что деньги действительно легли переплатой, а не ушли в зачёт другого платежа. Заодно выясните, на основании какого документа ФНС посчитала налог; учитывая срок владения, декларацию 3-НДФЛ в вашем случае можно было вообще не подавать.

Дальше подаётся заявление в ИФНС по месту учёта или через личный кабинет налогоплательщика, с реквизитами счёта, чтобы вернуть деньги. Если инспекция сама не соглашается, что требование было ошибочным, к заявлению стоит приложить документы о сроке владения квартирой - выписку из ЕГРН, договор покупки, чтобы подтвердить дату возникновения права собственности.

Полгода - не критичный срок, право на возврат переплаты по НК РФ не сгорает так быстро, у налогоплательщика есть несколько лет на обращение. Платёж состоялся, но правовых оснований для налога при соблюдённом сроке владения не было и нет. Если инспекция откажет в возврате уже сейчас, отказ можно обжаловать в вышестоящий налоговый орган, а затем и в суд, но чаще подобные ситуации закрываются на уровне обычного заявления, если документы о сроке владения в порядке. Право на возврат работает одинаково у физического лица и у ИП, продающего личное имущество вне предпринимательской деятельности.